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专家采访

LncRNA研究攻略你"噪"吗?

【2017-06-01】

非编码RNAncRNA)在许多生命活动过程中扮演着重要角色,曾被Science杂志评选为本世纪前10年的十大科学突破之一,该研究领域也是近期最热的生物学课题之一。其研究结果层出不穷,不断刷新着人们对ncRNA的认知。最近研究火热的课题circular RNA以及long non-coding RNAs(长链非编码)等,都属于ncRNA

今天,我们重点介绍的是长链非编码RNALncRNA)。

 

LncRNA简介

早期,LncRNA被认为是基因组转录的噪音,并不具有生物学功能。然而LncRNA用实力证明自己是绝对的潜力股!

研究表明,所有的LncRNA连在一起,为生物体生长发育和疾病进展过程织就了一张天罗地网。它能在表观遗传、转录及转录后水平调控基因表达,参与X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输、细胞分化和增殖等种种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系!

但是这些RNA分子究竟有何功能?它们背后的具体机制是什么?又有哪些研究策略呢?

 

LncRNA的基因主要功能

(1)LncRNA的基因调节功能

LncRNA种类繁多,且会在整个细胞中持续表达。目前已有研究表明LncRNAs几乎在基因表达的每个阶段都能发挥广泛的调节作用,一旦LncRNA表达异常则会导致多种疾病,如癌症、免疫疾病和神经病症等发生。

LncRNA的表达是随着生长发育进程而进行调控的,在不同的组织和细胞类型具有一定的特异性,且在空间和时间上因外界刺激的变化而变化。因而相比于编码蛋白质的基因,LncRNA在不同组织之间会展现出非常大的变化。


 

(2)LncRNA调控异常与疾病

研究已发现LncRNA在多种癌症中差异表达,包括白血病、乳腺癌、肝癌、结肠癌和前列腺癌。LncRNA失调的其他疾病还包括心血管疾病、神经系统疾病和免疫介导的疾病。

因肿瘤细胞内的LncRNA呈现一种异常状态,对肿瘤细胞的生长分化起着非常重要的影响。已经证实了一些LncRNA与多种肿瘤的不良预后有关,有一些LncRNA在多种人类癌症中表达异常而与肿瘤的进展息息相关。

 

(3)LncRNA的一般研究策略

目前,LncRNA的研究方法主要针对序列鉴定以及功能研究两大方面。 



序列鉴定

在序列鉴定方面主要运用微阵列、Northern印记技术,定量RT-PCR法,RNA测序法。

A. 定量RT-PCR

阅微基因运用成熟的实时定量检测技术,结合LncRNA的特点设计特异性引物,保证扩增的特异性和准确性,提供稳定的LncRNA表达检测结果。


lncRNA检测熔解曲线图

 

B. RNA测序法

直接测序法,转录测序法以及蛋白沉淀伴随LncRNA高通量测序法等分析明确该LncRNA的序列。

阅微基因利用高通量测序技术,并结合生物信息学的预测工具进行LncRNA分析,帮助科研工作者更快更有效的发现那些具有重要调控功能的LncRNA,分析其与特定生物学过程或者疾病的关系。 

别的不说,先展示一下实力:




LncRNA差异表达分析


我们的优势

  1.可获得样本中几乎全部的LncRNA序列信息,不局限于对已知LncRNA的研究,还可对未知的LncRNA进行预测;

  2.通过优化文库构建流程,使插入片段更长,更利于LncRNA的分析;同时减低了对RNA起始量与质量要求;

  3.数据分析不限于LncRNA,也可对环形RNA等非编码RNA进行分析;

  4.个性化跟踪分析,让数据分析更有针对性,更加顺畅。

 

功能研究

除了使用数据库以及生物工程软件进行功能预测外,主要的实验方法有:

原位检测法,以观察待检测LncRNA在细胞以及组织水平的定位和分布;使用载体构建,载体转染,基因敲除等方法过表达或沉默某个LncRNA,以观察其在细胞和动物体内的作用。


如果你想要了解更多LncRNA的研究策略,那么欢迎来和大咖们一起,共同探索LncRNA的神秘世界!